叶圣陶纪念馆位于保圣寺的西南侧，纪念馆建在“吴县县立第五高等小学”的原址上，1917年至1922年，叶圣陶先生曾在这里任教。在他逝世后，被辟为了叶圣陶纪念馆。纪念馆后面是一个花园，有叶先生在五高时创办的生生农场的旧址和叶圣陶先生的墓地。2019年，叶圣陶纪念馆所在的叶圣陶执教旧址和叶圣陶墓一起列入江苏省文物保护单位。现在这里也是民进中央会史教育基地、江苏省学校德育教育基地和爱国主义教育基地。

保圣寺西墙有门直通叶圣陶纪念馆，门楼为单间歇山顶砖雕门口，其上刻有赵朴初先生所题 “叶圣陶纪念馆”字样。纪念馆原为甪直吴县县立第五高等小学（简称“五高”）旧址，其前身为沈柏寒创办的甫里小学，最早可追溯到元代至顺年间钱光弼于陆龟蒙故居处建立的甫里书院。1907年，沈柏寒与地方开明人士商议创办甫里小学，改变旧的私塾教学方法为分科教学法，被百姓视作“洋学堂”。民国五年（1916年）时甫里小学高级部由吴县政府改设为“五高”，学制三年。1917年时，叶圣陶来到五高执教，开启文学创作之路。

进入纪念馆大门，有鹅卵石直通展览厅。道东边为女子楼，为2000年新修建筑。1919年，叶老夫人胡墨林应“五高”之聘，作为女子部教师，曾在此执教三年。道西面是“四面厅”，外形似一方亭，四面环通，当时为“五高”的博览室。“四面厅”西面是“鸳鸯厅”，乃当年“五高”的办公室和集体宿舍，环境优雅。

叶圣陶纪念馆展览厅展厅是一幢七开间的平房，门头悬挂李瑞环同志书“叶圣陶纪念馆”匾额。进门为序厅，大厅郑重纯白色弧形屏风前，立有叶圣陶先生半身铜像。屏风上为赵朴初先生的题词——“一代师表”。序厅两侧是陈列室，以大量照片、文字介绍了叶圣陶先生的一生。

鸳鸯厅是当年学校的核心区域，担任着学校办公室与教师集体宿舍的双重角色，更是叶圣陶先生及其同事们推动教育改革、培育英才的重要舞台。

面阔三间7.55米，进深10.1米，彰显了其作为教育场所的恢弘与庄重，确保内部空间的宽敞与实用，为教师们提供既舒适又高效的工作与生活环境。鸳鸯厅的名字里就蕴含着巧妙设计与深厚寓意，一道匠心独运的墙脊，以正态分布弧形的姿态自然而巧妙地将厅一分为二：南厅的梁柱橼子都是方木形状，北厅则是圆木结构；南北两厅各具特色，宛如鸳鸯比翼，故名“鸳鸯”厅。北厅，以圆木结构为主，圆润的线条营造出一种温馨舒适的居家氛围，是叶圣陶等五位教师的生活空间，充满了生活的气息与同事间的深厚情谊。还原了当时的宿舍布局，共有五张床位与桌椅，当时的校长吴宾若以及叶圣陶、王伯祥等均在这里居住和办公。墙上是当时甪直“五高”教师的合影。从左往右依次是：殷康伯、叶圣陶、孙鑑平、王伯祥、朱韫石、吴宾若、沈君宜、徐毓才、董志尧、陈詠霓（二排左二为叶圣陶）。衣柜、脸盆架、床下的行李箱、桌上的热水壶，以及一些其他的摆件都是依据文献资料，复原再现了当时的场景。南厅体现出一种严谨与秩序之美，这里的梁、柱、椽子都采用了方木，线条硬朗。南厅曾是教师们探讨学术、交流思想的办公室，更是起草声援“五四”运动罢课宣言的地方。在这里，叶圣陶先生与同事们共同商讨教育改革的大计，他们勇于突破封建教育制度的桎梏，进行了一系列前所未有的教育实验，为中国的现代教育发展开辟了新的道路。

博览室（四面厅）四面厅外似方亭，圆柱矮墙，四面环通，台基为正方形，亭内门墙间隔，形成一座小厅。这里是当年“五高”的博览室，经常存放中外名著及进步刊物，供学生阅读。

女子楼原本为一幢南北四开间的两层楼房，上下共四间，楼上是教室和办公室，楼下是礼堂、音乐教室。叶圣陶妻子胡墨林曾在此执教，担任女子部教师，叶老也曾为夫人代课。叶圣陶先生的童话集《稻草人》中的一些故事，就是在这里与最早的“读者”见面的。如今，女子楼的楼下开辟了家风展并复原了女子教室，楼上则是吴中政协文史展。